\ Hüseyin Çimen
hc

Hüseyin Çimen

Yard. Doç. Dr.

3259 B503

AD SOYAD/ÜNVAN AKADEMİK BİLGİLER İLETİŞİM
    Hüseyin Çimen Yard. Doç. Dr. —————– —————– Eğitim Durumu M.Sc. - Ph.D.: Biyokimya, Mikrobiyoloji ve Moleküler Biyoloji, The Pennsylvania State University (A.B.D.) B.Sc.: Moleküler Biyoloji ve Genetik, Orta Doğu Teknik Üniversitesi Araştırma Alanı (Anahtar Kelimeler) Biyoteknoloji, proteomiks, fosfoproteomiks, asetoproteomiks, mitokondri, obezite, diyabet, metabolik bozukuluklar ve hastaliklar, protein sentezi, NAD, sirtuin, SIRT3, yaşlanma, uzun ömürlülük, kanser, bor, oksidatif fosforilasyon, parkinson hastaligi, mitokondriyal biyogenez, deasetilasyon, suksinat dehidrogenaz, kutle spektrometrisi, iki boyutlu jel elektroforezi, nikotinamid, kamferol, yazilim sonrasi modifikasyonlar, kalori kisitlamasi, NADH, ATP, asetil-KoA, SILAC, biyomarkır, biyoişaretleyici, metabolomiks, nicel-kantitatif proteomik, SRM, MRM, protein ayristirma ve saflastirma. Ofis B516 Telefon +90 216 578 0000 Dahili:3259 E-Posta huseyin.cimen@yeditepe.edu.tr Web Sayfası http://proteomics.yeditepe.edu.tr/
LABORATUVAR ARAŞTIRMA - PROJE
Proteomiks ve Hücre Kültürü Laboratuvarı (B5.51)
  • Bor temelli bileşiklerin memeli hücrelerde, hücresel ve mitokondriyal metabolizma ve yaşlanma üzerine etkileri
  • Bor temelli bileşiklerin uygulaması sonucu ortaya çıkan asetilasyon değişimlerinin Kütle Spektrometri ile incelenmesi
  • Berberin, resveratrol ve kersetin gibi doğal bitki özütlerinin kanser hücrelerinde mitokondri üzerine etkilerinin nutriproteomik çalışmalar ile değerlendirilmesi
SEÇİLMİŞ YAYINLAR VE AKTİVİTELER
  1. Akademik ve Mesleki Deneyim
Görev Dönemi Unvan Üniversite Bölüm
2013 - Yard. Doç. Dr. Yeditepe Üniversitesi Genetik ve Biyomühendislik
2012 - 2013 Okutman Yeditepe Üniversitesi Genetik ve Biyomühendislik
2011 - 2012 Doktora Araştırma Görevlisi Marshall University (A.B.D.) Biyokimya ve Mikrobiyoloji, Joan C. Edwards Tıp Fakültesi
2006 - 2012 Araştırma Görevlisi The Pennsylvania State University (A.B.D.) Biyokimya, Mikrobiyoloji ve Moleküler Biyoloji
PhD  The Pennsylvania State University (A.B.D.)          Biyokimya, Mikrobiyoloji ve Moleküler Biyoloji, Ağustos 2012          Doktora Tezi Başlığı: “Regulation of mitochondrial translation and oxidative phosphorylation through reversible acetylation.  
  1. Yayın Bilgileri
ISI indeksine kayıtlı dergilerde yayınlanan 7
Diğer indekslere kayıtlı / Hakemli dergilerde yayınlanan 1
İndekslere kayıtlı / Hakemli konferans kitaplarında yayınlanan 7
TOPLAM 15
 
  1. Yayınlara Alınan Toplam Atıf Sayısı
Web of Science 181
Google Scholar 274
 
  1. Yayınlar
         4.1.  Uluslararası hakemli dergilerde yayınlanan makaleler (SCI & SSCI & Arts and Humanities) 2013         1. Cimen H, Kumcuoglu B, Abu N, Akpinar G, Haque ME, Spremulli LL, Koc H, Koc EC, Identification and characterization of CHCHD1, AURKAIP1, and CRIF1 as new members of the mammalian mitochondrial ribosome. Front. Physiol. Jun 26;4:183. doi: 10.3389/fphys.2013.00183.   2012         2. Zhu JH, Gusdon AM, Cimen H, Van Houten B, Koc E, Chu CT. Impaired mitochondrial biogenesis contributes to depletion of functional mitochondria in chronic MPP(+) toxicity: dual roles for ERK1/2. Cell Death Dis. May 24;3:e312. doi: 10.1038/cddis.2012.46.   2011         3. Haque ME, Koc H, Cimen H, Koc EC, Spremulli LL. Contacts between mammalian mitochondrial translational initiation factor 3 and ribosomal proteins in the small subunit. Biochim Biophys Acta. 1814(12), 1779-84  
  1. Surovtseva YV, Shutt TE, Cotney J,Cimen H, Chen SY, Koc EC, Shadel GS. Mitochondrial ribosomal protein L12 selectively associates with human mitochondrial RNA polymerase to activate transcription. Proc Natl Acad Sci USA. 108(44),17921-6
 
  1. Han MJ,Cimen H, Miller-Lee JL, Koc H, Koc EC. Purification of human mitochondrial ribosomal L7/L12 stalk proteins and reconstitution of functional hybrid ribosomes in Escherichia coliProtein Expr Purif. 78(1), 48-54.
  2010         6. Yang Y*, Cimen H*, Han MJ*, Shi T, Deng JH, Koc H, Palacios OM, Montier L, Bai Y, Tong Q, Koc EC. NAD+-dependent deacetylase SIRT3 regulates mitochondrial protein synthesis by deacetylation of the ribosomal protein MRPL10. J Biol Chem. 285(10), 7417-29. (*: contributed equally)  
  1. Cimen H, Han MJ, Yang Y, Tong Q, Koc H, Koc EC. Regulation of succinate dehydrogenase activity by SIRT3 in mammalian mitochondria. Biochemistry49(2), 304-11.
  2009         8. Miller JL, Cimen H, Koc H, Koc EC. Phosphorylated proteins of the mammalian mitochondrial ribosome: implications in protein synthesis. J Proteome Res. 8(10), 4789-98.            4.2. Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında (Proceedings) basılan bildiriler 2012         21-25.Nisan:             Cimen H, Koc H, Koc EC. A newly identified protein regulates translation in mammalian mitochondria. Experimental Biology 2012 meeting, April 21-25, 2012. San Diego Convention Center, San Diego, CA   2011         9-13.Nisan:               Cimen H, Han MJ, Tong Q, Koc H, Koc EC. SIRT3 regulates mitochondrial translation by modulating MRPL12 binding to ribosome. Experimental Biology 2011 meeting, April 9-13, 2011. Walter E. Washington Convention Center, Washington, DC   2009         24-27.Haziran:           Cimen H, Yang Y, Shi T, Han MJ, Deng JH, Koc H, Palacios OM, Montier L, Bai Y, Tong Q, Koc EC. NAD+-dependent deacetylase SIRT3, regulates mitochondrial protein synthesis by deacetylation of the ribosomal protein, MRPL10. Mitochondrial Medicine 2009, June 24-27, 2009. Sheraton Premiere at Tysons Corner, Vienna, VA (Selected for an oral presentation and received Third-Place Runner Cash Award) 24-27.Haziran:           Han MJ, Cimen H, Koc H, Koc EC. Role of MRPL10 acetylation on mitochondrial translation. Mitochondrial Medicine 2009, June 24-27, 2009. Sheraton Premiere at Tysons Corner, Vienna, VA   2008         3-7.Eylül:                 Cimen H, Yang Y, Shi T, Han MJ, Deng JH, Koc H, Palacios OM, Montier L, Bai Y, Tong Q, Koc EC. Regulation of mitochondrial protein synthesis by a mitochondrial NAD+-dependent deacetylase SIRT3. Translational Control Meeting, September 3-7, 2008. Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY 3-7.Eylül:                 Cimen H, Han MJ, Koc H, Koc EC. Translational Control Meeting, September 3-7, 2008. Detection and mapping acetylation sites in the mammalian mitochondrial ribosomal protein L10 (MRPL10). Translational Control Meeting, September 3-7, 2008. Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY
  1. Ödüller
2012         _ ASBMB Annual Meeting Grad./ Postdoc. Travel Award _ Graduate Student Research Travel Award, Joan C. Edwards School of Medicine, Marshall University   2011         _ Braucher Pela Fay Scholarship, Dept. of Biochemistry and Molecular Biology, Pennsylvania State University _ ASBMB Annual Meeting Grad./ Postdoc. Travel Award _ BMB Graduate Student Travel Award, Dept. of Biochemistry and Molecular Biology, Pennsylvania State University _ Gradute Exhibition, Graduate School, Pennsylvania State University   2007         _ Homer F. Braddock Fellowship, Dept. of Biochemistry and Molecular Biology, Pennsylvania State University
 
DERSLER
GBE111 Biyoloji I (Lisans)
GBE102 Biyoloji II (Lisans)
GBE403 Moleküler Biyoloji I (Lisans)
GBE442 Genomiks, Proteomiks, Biyoinformatik (Lisans)
BTEC502 Tıbbi ve Klinik Genetik (Lisansüstü)
BTEC539 Protein Kimyası (Lisansüstü)
BTEC606 Transgenik ve Gen Terapisi (Doktora)
BTEC615 Protein Saflaştırılması ve Analizi  (Doktora)
BTEC641 Proteomiks ve Kütle Spektrometrisi  (Doktora)

Yeditepe Üniversitesi, Genetik ve Biyomühendislik Bölümü,
26 Ağustos Yerleşimi, Kayışdağı Cad. 34755 Ataşehir, İstanbul

(216) 578 0619 dileks@yeditepe.edu.tr